高純水蒸餾器開箱后將冷凝管取出來，消毒后插入橫式燒瓶的磨口上蒸餾水的的出水口(應面向前面)，使水位器上管口的橡皮管另一端套在冷凝管的上出水口上，前一段短橡皮管套在水位器出水口部，但應注意管路暢通，并不得高于出水口處的水平線，以免影響蒸餾瓶內(nèi)的水位，現(xiàn)用橡皮管套在冷凝管下部進水口，并與水源相連，自來水即由冷卻管、水位器到橫式燒瓶內(nèi)，其水位高度由水位器控制，冷卻水的路線是自來法，進入二次冷卻管的下進水口，經(jīng)由上出水口流入一次冷卻管的下進水口，由上出水口流入水位器，在初次蒸餾時，接通電源，一次蒸餾先行開始，蒸餾之水流入二次蒸餾瓶中，待水位達到應有的高度后(約1小時)插上二次電源插頭，二次蒸餾開始蒸餾，出來的蒸餾水純度有進一步提高。